Sól (chlorek sodu) składa się z dwóch elementów: sodu i chloru. Podczas instalacji generatora odmierzona ilość soli jest rozpuszczana w wodzie basenowej, powodując, że staje się ona lekko słona. Podczas przepływu wody przez elektrolizer powstaje chlor, który rozpuszczany jest w wodzie. Chlor natychmiast niszczy bakterie,wirusy, algi oraz utlenia inną organiczną materię.Generator musi być podłączony jako odtatni element zestawu basenowego, tak aby znajdował się blisko podłączenia zaworu powrotnego wody. Takie ustawienie przedłuży żywotność tytanowych elektrod. Należy używać tylko zwykłej soli kuchennej(NaCl); zabronione jest używanie soli jonizowanej. Im czystsza sól, tym większa wydajność ogniw.